Benzoesäure wird aus verschiedenen Bakterienstämmen durch Desaminierung aus Phenylalanin gebildet. In der Leber wird sie an Glycin und Vitamin B5 gebunden und zu Hippursäure umgewandelt. Erhöhte Benzoesäurewerte im Urin weisen auf einen Mangel an diesen Nährstoffen hin.
Es ist jedoch zu beachten, dass Benzoesäure auch über die Nahrung aufgenommen wird (Pflaume, Heidelbeere, Cranberry; viele Lebensmittel enthalten benzoesäurehaltige Konservierungsstoffe).