Von den sogenannten nicht-pathogenen Darmprotozoen gehört Endolimax nana zu den am wenigsten gut beschriebenen. Die meisten Daten über E. nana stammen aus allgemeinen Untersuchungen von Darmparasiten in ausgewählten Kohorten und meist ohne spezifischen Fokus auf Endolimax. Endolimax wird durch fäkal-orale Kontamination von Lebensmitteln oder Wasser übertragen. Endolimax-Zysten wurden in Trinkwasser aus tiefen Brunnen, auf roh verzehrtem Gemüse und auf Banknoten nachgewiesen.