Die Darmflora wird von Bacteroidetes und Firmicutes dominiert. Methanobrevibacter smithii ist das am häufigsten vorkommende methanogene Archaeon in der menschlichen Darmflora und besitzt eine kokkobazilläre Form. M. smithii ist ein Mikroorganismus, der häufig im Darm und im Stuhl gesunder Menschen vorkommt und eine wichtige Rolle bei der effizienten Verdauung von Polysacchariden (komplexen Zuckern) spielt. M. smithii erreicht dies, indem Wasserstoff mit Kohlendioxid kombiniert wird, um Methan zu produzieren, wodurch die Energiegewinnung aus Nährstoffen unterstützt wird. Methanproduzierende Mikroorganismen werden als Methanogene bezeichnet. Methanobrevibacter smithii kann bis zu 10 % aller anaeroben Bakterien (sauerstoffmeidend) im Dickdarm ausmachen.